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BIOPHYSICS RESEARCH DIGEST

生物物理科研日报

2026-11-03 · 完整自然日 · 精选 19 篇(期刊 7、预印本 12)

精选 01 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

复凝聚体液滴作为 RNA 聚集体固液转变的液化剂

Coacervate droplets as a liquefier for the solid-to-liquid transition of RNA aggregates

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Wei Guo

实验与全原子模拟表明,复凝聚体可渗入固化的 RNA–肽聚集体,通过纳米尺度分子缓冲削弱交联网络并诱导宏观液化;小分子阴离子形成的复凝聚体效果最佳,还可恢复模型病理聚集体中被沉默 RNA 的功能。

推荐理由: 提出主动调控生物分子凝聚体材料状态的可设计机制,兼具软物质新意与生物物理意义。

精选 02 · 期刊 · Physical Review Letters

利用位移对称性构建远离平衡的有效场论

Building Far-from-Equilibrium Effective Field Theories Using Shift Symmetries

Physical Review Letters · 第一作者:Xin An

作者以位移对称性为原则构建远离平衡的流体动力学有效作用量,把弱耦合与强耦合场论中不同的非流体瞬态统一为该对称性的不同实现,并纳入流体动力学区外的随机涨落及可插值混合模型。

推荐理由: 为远离平衡热化建立统一有效场论结构,基础非平衡理论贡献突出。

精选 03 · 期刊 · Nature Communications

含复凝聚体液滴中的双相酶反应

Biphasic enzymatic reaction in coacervate-containing droplets

Nature Communications · 第一作者:Yuhao Geng

作者构建单液滴含单复凝聚体的微流控阵列,结合时空成像、整体动力学和数学模型,定量连接分子跨相重分布、反应驱动通量与酶促去磷酸化,并展示复凝聚相的噪声缓冲作用。

推荐理由: 直接研究受限双相液滴中的反应—扩散耦合和催化调控,是生物凝聚体与非平衡软物质的重要工作。

精选 04 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

油水界面上的气膜自发扩展

Spontaneous gas film expansion at an oil–water interface

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Bowen Zhang

作者证明微柱限域可通过润湿、毛细压力与气体输运耦合,使热力学上不利的气膜在油水界面自发横向扩展;建立的输运—毛细框架预测形态转变和特征时间,且空间图案化微结构可控制传播路径。

推荐理由: 揭示限域多相界面中的非平衡形态转变与可编程传播,是界面软物质的重要结果。

精选 05 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

亚细胞区室决定信号优势:内体 cAMP 压倒同一受体并发的质膜 RhoA 激活

Subcellular compartment determines signal dominance: Endosomal cAMP overrides concurrent plasma membrane RhoA activation from a single receptor

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Sofya Savransky

同一 GPCR 激活后,质膜 G13/RhoA 与内体 Gs/cAMP 信号功能相反;持续的内体 cAMP 可压倒质膜 RhoA 激活并反转净输出,阻断内吞或内体 Gs 会完全逆转该结果。

推荐理由: 清楚展示信号空间区室如何决定细胞网络输出,对动态信号生物物理有价值。

精选 06 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

快冷与慢冷:表征冷冻电镜玻璃化效应及平衡群体恢复

Cooling fast and slow: Characterizing the effects of vitrification in cryo-EM and the subsequent recovery of equilibrium populations

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Robert Clark

长时间分子动力学和马尔可夫态模型显示,冷却持续时间长于其特征时间的构象态更能抵抗玻璃化伪影;作者进一步提出从玻璃化系综恢复平衡布居的热力学推断框架。

推荐理由: 定量处理冷冻电镜样品制备对构象系综的非平衡扰动,方法意义明确。

精选 07 · 期刊 · Journal of Fluid Mechanics

自由表面附近固定浸深自推进波动水翼的流体动力学

Hydrodynamics of a self-propelled undulating hydrofoil at fixed submergence near a free surface

Journal of Fluid Mechanics · 第一作者:Tian-Yu Gao

数值研究显示,自推进波动水翼靠近自由表面时巡航速度随浸深减小而下降,效率则存在最优浸深;浅水条件下还存在使速度最大的波长,并给出速度、浸深与波长的标度关系。

推荐理由: 与生物启发推进及自驱动流体力学直接相关,方法和结论较明确。

精选 08 · 预印本 · arXiv

活性趋化 Janus 粒子的动态成簇

Dynamic clustering of active chemotactic Janus particles

arXiv · 第一作者:Joël Mabillard

三维扩散泳模型和线性稳定性分析显示,活性趋化 Janus 胶体的动态成簇区在相图中占据稳健范围;成簇源于 Keller–Segel 塌缩与运动诱导相分离的共同作用,并被化学场对取向的耦合阻滞。

推荐理由: 统一两类核心活性物质成簇机制,理论贡献明确且高度贴合主线。

预印本,尚未经同行评议。

精选 09 · 预印本 · arXiv

通过非局域噪声在随机组织中设计可调超均匀性

Designing tunable hyperuniformity in random organization through nonlocal noise

arXiv · 第一作者:Yusheng Lei

作者在偏置随机组织中构造两种非局域噪声机制,证明粒子动力学产生的噪声谱可选择超均匀指数,同时保留普通扩散和质心守恒;连续场论与粒子模拟支持结构因子长波标度可由幂律位移分布连续调节。

推荐理由: 把可设计微观驱动与非平衡超均匀长程关联直接连接,具有清晰理论新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 10 · 预印本 · bioRxiv

分子机器测量生物膜纳米力学

Molecular machines measure the nanomechanics of biological membranes

bioRxiv · 第一作者:Rottensteiner, A. · 通讯作者:Stefan Howorka

作者用 DNA 纳米技术制造可自主结合膜、局部压入并把纳米级形变转为光学读出的分子机器,可并行测量膜弹性;进入细胞后,该工具分辨出较软的内部膜区室与较硬的胞质膜。

推荐理由: 将压痕力学缩小至分子尺度并实现活细胞膜纳米力学读出,方法新颖且高度相关。

预印本,尚未经同行评议。

精选 11 · 预印本 · arXiv

手性螺旋聚合物的力学性质:从单丝到肌动蛋白束

Mechanical properties of chiral helical polymers-from single filaments to actin bundles

arXiv · 第一作者:Amir Khosravanizadeh

作者建立保持螺旋性和手性的高度粗粒化细丝模型,并匹配实验肌动蛋白力学;模拟显示马达沿螺旋细丝运动会产生手性运动,成束后马达施加转矩,引发旋转、卷曲和螺旋屈曲。

推荐理由: 直接连接细胞骨架手性、细丝力学与马达驱动集体动力学,和生物活性物质高度相关。

预印本,尚未经同行评议。

精选 12 · 预印本 · bioRxiv

机械耦合使上皮细胞群在到达瓶颈前预先变窄

Mechanical coupling narrows an epithelial colony before it reaches a bottleneck

bioRxiv · 第一作者:Yu, S.-M. · 通讯作者:Steve Granick

MDCK 单层在进入较窄通道前即从侧壁脱离并横向收缩,伴随非周期流向反转、正速度散度和边缘 E-cadherin/F-actin/ 肌球蛋白 -II 高张力带;敲低 E-cadherin 会消除这些预响应。

推荐理由: 揭示黏附与主动机械耦合如何使组织提前适应几何瓶颈,直接相关于活性组织流动。

预印本,尚未经同行评议。

精选 13 · 预印本 · arXiv

水合多孔基底调控细菌湍流的时空动力学

Hydrated porous substrates modulate the spatiotemporal dynamics of bacterial turbulence

arXiv · 第一作者:Zixiang Lin

稀、密大肠杆菌悬浮液实验显示,琼脂浓度以非单调方式影响近界面集体动能,且随时间出现更短空间关联、更长时间关联和更小流动结构;加入渗流与滑移的平均场动理学稳定性分析定性解释了这些基底依赖变化。

推荐理由: 直接研究多孔边界对活性细菌湍流强度、持续性和空间组织的调控,和研究主线高度吻合。

预印本,尚未经同行评议。

精选 14 · 预印本 · arXiv

通过几何投影模拟硬胶体和黏性胶体的长时布朗动力学

Long-time Brownian dynamics of hard and sticky colloids by geometric projection

arXiv · 第一作者:Rémi Martin

作者用几何投影替代硬球排斥、黏性键和硬壁近接触刚性力的显式积分,使过阻尼布朗动力学可跨越更长时间;方法保持结构与扩散并复现聚集动力学,计算可达物理时间提高一至两个数量级。

推荐理由: 为致密约束胶体的长时布朗动力学提供有效粒子尺度工具,软物质方法贡献明确。

预印本,尚未经同行评议。

精选 15 · 预印本 · arXiv

用机器学习粗粒化模型探索脂质世界

Exploring the World of Lipids with Machine-Learned Coarse-Grained Models

arXiv · 第一作者:Aldo S. Pasos-Trejo

作者将物理项与图神经网络结合,训练隐式溶剂 POPC 粗粒化势;模型较现有模型更准确复现膜结构与动力学,并在训练范围外稳定囊泡、重现膜和囊泡自组装及孔洞封闭。

推荐理由: 面向脂质膜复杂协同行为的机器学习粗粒化模型,对生物软物质模拟价值突出。

预印本,尚未经同行评议。

精选 16 · 预印本 · bioRxiv

核纤层变形与重塑的预测性力化学建模框架

A predictive mechanochemical modeling framework for the deformation and remodeling of the nuclear lamina

bioRxiv · 第一作者:Francis, E. A. · 通讯作者:Padmini Rangamani

有限元模型将核膜—纤层的非线性弹性变形与纤层重塑、核质运输耦合,预测纳米柱间距对核膜张力、YAP/TAZ 入核和破裂概率的影响,并由实验验证关键趋势。

推荐理由: 把微环境拓扑、核力学与生化运输统一起来,是细胞力学生物学的重要工作。

预印本,尚未经同行评议。

精选 17 · 预印本 · bioRxiv

单分子扩散揭示膜蛋白在靶膜表面的快速平移

Single Molecule Diffusion Studies Reveal Rapid Translations Across Target Membrane Surfaces for both p40Phox PX domain and Class III PI3K VPS34 Complex 1, the Autophagy Lipid Kinase

bioRxiv · 第一作者:Lizardos, L. · 通讯作者:Joseph J Falke

单分子追踪显示 PX 结构域和 VPS34 复合物先在阴离子膜表面进行静电跳跃,随后进入摩擦更大的稳定二维扩散;特异脂质控制稳定停靠及再跳跃行为。

推荐理由: 直接解析膜蛋白表面搜索与停靠动力学,是膜生物物理的重要机制。

预印本,尚未经同行评议。

精选 18 · 预印本 · bioRxiv

用于大分子蛋白动力学、变构与动力学的可扩展接触门控随机算符和普适降维律

Scalable Contact-Gated Stochastic Operators and Universal Reduction Laws for Macromolecular Protein Dynamics, Allostery, and Kinetics

bioRxiv · 第一作者:Singh, M. · 通讯作者:Mehardeep Singh

作者在多种蛋白和显式溶剂轨迹上构建接触门控、满足热力学约束的随机降阶算符,利用局域稀疏接触图提升尺度扩展,并报告其可预测慢模、NMR 序参量、变构通路与反应坐标记忆。

推荐理由: 面向蛋白动力学与变构的连续随机降阶框架具有明确计算生物物理价值。

预印本,尚未经同行评议。

精选 19 · 预印本 · bioRxiv

FoxO1 与 HNF1α 协同重塑核小体结构和机械稳定性以激活转录

FoxO1 and HNF1α cooperatively remodel nucleosome architecture and mechanical stability to activate transcription

bioRxiv · 第一作者:Florez Ariza, A. J. · 通讯作者:Eva Nogales

冷冻电镜与力谱显示,FoxO1 促进核小体远端 DNA 解包并降低机械稳定性,HNF1α 则以不同方式重塑解体动力学;二者协同招募并改变受力解体路径,细胞内足迹分析支持相应染色质状态变化。

推荐理由: 直接连接转录因子协同、核小体结构和机械稳定性,是染色质力学生物学的重要结果。

预印本,尚未经同行评议。

依据标题与摘要整理;论文链接指向原始出处。

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生物物理科研日报

2026-11-02 · 完整自然日 · 精选 27 篇(期刊 12、预印本 15)

精选 01 · 期刊 · Physical Review E

异常软核流体中的活性与竞争长度尺度

Activity and competing length scales in an anomalous core-softened fluid

Physical Review E · 第一作者:Davi Felipe Kray Silva

作者研究具有双竞争长度尺度相互作用的活性布朗粒子,发现自推进逐渐削弱被动软核流体的水样异常;由稳态配对关联反演的有效相互作用表明,活性促进两类局域环境之间的粒子转移,从而降低产生异常响应的结构竞争。

推荐理由: 直接解析活性如何重塑竞争尺度、结构与动力学,属于高度相关的活性软物质研究。

精选 02 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

三维限域重塑 RNA 折叠并增强寨卡病毒基因组环化

3D confinement reshapes RNA folding and enhances circularization in the Zika virus

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Javor K. Novev

作者把邻近连接数据纳入粗粒化分子动力学,比较寨卡病毒约 11 kb RNA 在病毒粒子限域与细胞内非限域状态的折叠;实验和模拟均显示限域改变接触标度并提高基因组环化概率,长双链茎还产生局域向列液晶序。

推荐理由: 直接揭示几何限域如何重塑长 RNA 的构象系综、标度与液晶序,是高度相关的生物软物质研究。

精选 03 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

Colletes 蜂产生的交联半结晶聚乙烯样聚酯在土壤中快速降解

Rapid soil degradation of a cross-linked, semicrystalline polyethylene-like polyester produced by <i>Colletes</i> bees

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Jonathan P. Coote

作者表征 Colletes 蜂巢衬里的交联高结晶聚乙烯样聚酯,发现其在环境土壤中数月内显著降解;低交联密度、缺少高阶层片结构及酯酶活性可能使更多酯键暴露并促进裂解。

推荐理由: 把聚合物微结构、结晶、交联与环境降解联系起来,对可降解软材料设计具有重要启发。

精选 04 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

细胞群体聚集驱动图案形成的尺度伸缩极限

The limits of scaling in aggregation-driven patterning of cell collectives

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Michael L. Zhao

作者结合胚胎前体细胞限域实验、成像、化学扰动和仅含细胞吸引的连续模型,确认聚集是后极形成的起始事件;模型和实验共同显示,有限发育时间使大系统的粗化变慢,从而形成尺度—时间权衡并限制图案按比例缩放。

推荐理由: 把细胞吸引、粗化动力学和发育尺度律定量连接,是生物软物质与非平衡图案形成的核心问题。

精选 05 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

周细胞收缩通过细胞力依赖的 TGFβ 激活产生抗血管生成作用

Pericyte contraction generates angiostatic effect via cell force–dependent activation of TGFβ

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Carole Y. Perrot

作者报告周细胞的 R-Ras 介导收缩通过整合素和肌动球蛋白牵引力激活 TGFβ,进而经内皮 ALK5–Smad2/3 维持静息;小鼠周细胞 Rras 缺失会降低收缩和该信号,并伴随血管生成增加与血管变形。

推荐理由: 直接揭示细胞力如何转化为血管稳态信号,是力学生物学的重要机制。

精选 06 · 期刊 · Nature Communications

胶质母细胞瘤侵袭的单细胞时空动力学重建

Reconstructing the single-cell spatiotemporal dynamics of glioblastoma invasion

Nature Communications · 第一作者:Hitesh Bhagavanbhai Mangukiya

作者以活体脑片成像、形态分类和状态转移模型实时重建患者来源胶质母细胞瘤的单细胞侵袭,发现表型切换具有患者特异性和空间组织,并受血管、微胶质及治疗影响。

推荐理由: 把肿瘤侵袭转化为可测的细胞状态动力学,对细胞迁移与组织环境研究有明确交叉价值。

精选 07 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

结合位点作为共进化编码信息流的动态枢纽

Binding sites as dynamic hubs of coevolution encoded information flow

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Kemal Demirtaş

作者把共进化信息与高斯网络模型的转移熵结合,在 29 个案例中发现结合位点是集体信息传递枢纽,并呈现模态依赖、方向性的位点间信息流。

推荐理由: 以统计网络动力学连接序列共进化与蛋白变构,生物物理方法贡献明确。

精选 08 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

CqsS 群体感应信号转导及其受自诱导物合酶 CqsA 抑制的分子基础

Molecular basis of quorum-sensing signal transduction by CqsS and its inhibition by CqsA, the autoinducer synthase

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Mengchan Liu

冷冻电镜、生化和遗传分析解析 CqsS 的顺式自磷酸化、反式磷酸转移以及 CAI-1 结合引发的跨膜构象变化,并发现 CqsA 与 CqsS 胞内域结合可抑制激酶活性。

推荐理由: 为细菌群体感应及集体行为协调提供结构机制,生物物理价值明确。

精选 09 · 期刊 · Nature Communications

小胶质细胞依赖的 PDGFB–KCND2 调控决定丙泊酚麻醉诱导

Microglia-dependent PDGFB regulation of neuronal KCND2 in the hypothalamic paraventricular nucleus determines propofol anesthesia induction

Nature Communications · 第一作者:Boxu Cao

小鼠研究表明,小胶质细胞依赖的 PDGFB 信号通过调控下丘脑室旁核 KCND2、神经元兴奋性及其投射回路影响丙泊酚麻醉敏感性。

推荐理由: 揭示非神经元组分调控神经回路状态的机制,具有生物物理相邻价值和期刊实验支撑。

精选 10 · 期刊 · Nature Communications

婴儿源双歧杆菌 PNGaseA 偏好 N- 糖肽的结构基础

Structural basis for N-glycopeptide preference in an infant-derived Bifidobacterium bifidum PNGaseA

Nature Communications · 第一作者:Cassie R. Bakshani

结构、生化与分子动力学分析显示,婴儿源双歧杆菌 PNGaseA 通过附加 β 折叠托架及其闭合运动识别糖肽,并偏好糖肽而非完整或变性蛋白上的 N- 糖链。

推荐理由: 提供酶底物选择性和构象耦合的结构机制,具有分子生物物理价值。

精选 11 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

阿片类药物抑制结肠运动的悖论效应

Paradoxical effects of opioids in suppression of colonic motility

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Salah A. Baker

小鼠结肠实验显示,阿片受体激动剂主要抑制硝能抑制性而非胆碱能兴奋性运动输入,改变间质细胞和肌细胞活动,并破坏产生推进收缩所需的定时解除抑制。

推荐理由: 从神经—肌肉动力学解释结肠运动异常,具有生理生物物理价值。

精选 12 · 期刊 · Physical Review E

作为贝叶斯逆输运问题的人口动力学

Human population dynamics as a Bayesian inverse transport problem

Physical Review E · 第一作者:Chong Qi

作者仅依据摘要研究了“作为贝叶斯逆输运问题的人口动力学”所述问题,并报告了相应的方法与结果。

推荐理由: 与当前活性物质、非平衡物理、软物质及生物物理重点的直接关联有限。

精选 13 · 预印本 · arXiv

用自对齐可变形活性膜基准测试上皮单层流动

Benchmarking the flow of epithelial cell monolayer with self-aligning deformable active membranes

arXiv · 第一作者:Marcos Pasa

作者以可变形、黏附且自推进方向向速度松弛的活性膜模型模拟上皮单层绕障碍流动;改变自对齐时间、黏附与入口驱动可覆盖无序液态到高度对齐固态,并把细胞形变与组织输运联系起来,速度剖面与 MDCK 实验定性一致。

推荐理由: 模型直接整合活性、自对齐、可变形性和组织流动,是活性生物软物质的高度相关贡献。

预印本,尚未经同行评议。

精选 14 · 预印本 · arXiv

极性编程的空间图案化活性聚合物拓扑门控

Polarity-Programmed Topological Gating of Knotting in Spatially Patterned Active Polymers

arXiv · 第一作者:Shiqi Zhou

朗之万模拟显示,在活性区位置与强度相同的情况下,反转两个末端活性块的推进极性可使稳态打结概率跨越三个数量级;动力学分解指出主要变化来自结寿命,并提出源—输运—储库—汇机制解释结的生成、迁移、储存和消失。

推荐理由: 以空间活性和有符号极性可编程控制聚合物拓扑,兼具非平衡机制新意和软物质设计意义。

预印本,尚未经同行评议。

精选 15 · 预印本 · arXiv

有界熵产生约束归巢鸽群的层级决策

Bounded entropy production constrains hierarchical decision-making in homing pigeon flocks

arXiv · 第一作者:Bibaswan Ghosh

作者从归巢鸽轨迹推断导航群体的领导—追随层级,发现群体增大时层级减弱;热力学分析显示该趋势与维持每只鸟近恒定的熵产生率相容,提示信息处理成本约束活体集体决策。

推荐理由: 把真实动物群体的非互易交流、层级结构与熵产生联系起来,直接契合活性集体和生物物理。

预印本,尚未经同行评议。

精选 16 · 预印本 · arXiv

觅食集体中的涌现间接协作与信息素引导决策

Emergent stigmergy and pheromone-guided decisions in a foraging collective

arXiv · 第一作者:Manoj N H

作者把蚂蚁往返觅食建模为无限时域随机最优控制问题,使信息素动力学从前向 Hamilton–Jacobi–Bellman 方程中涌现;模型再现同长路径的自发对称破缺、短桥选择及暂时锁定长桥的双稳态。

推荐理由: 以统一动力学框架解释信息素反馈和集体决策,直接相关于活体集体与非平衡行为。

预印本,尚未经同行评议。

精选 17 · 预印本 · arXiv

拥挤环境中酶活性的力化学调控

Mechano-chemical control of enzymatic activity in crowded environments

arXiv · 第一作者:Michalis Chatzittofi

作者建立被动拥挤剂浴中燃料驱动酶的非平衡力化学模型,得到涨落诱导的有效力偶极;该机械负载随催化循环改变构象相关势垒,可产生单调抑制或非单调周转变化,并以热力学一致方式联系拥挤环境与催化流。

推荐理由: 将大分子拥挤、软物质涨落与酶的非平衡催化直接耦合,问题与机制都高度契合生物物理主线。

预印本,尚未经同行评议。

精选 18 · 预印本 · bioRxiv

模拟珠子系留生物分子:光镊力谱中的力探针耦合牵引分子动力学

Simulating Bead-Tethered Biomolecules: Force-Probe Coupled Steered Molecular Dynamics (fp-SMD) in Optical Tweezers Force Spectroscopy

bioRxiv · 第一作者:Zhang, G. · 通讯作者:Yongsheng Leng

作者把光阱微珠与分子—连接体纳入同一动力学描述,并以预测—校正方案跨越实验与分子模拟的时间尺度差;在胆固醇—环糊精体系中直接复现实验断裂力分布,并报告外力诱导的解离路径切换。

推荐理由: 把单分子力谱装置动力学与分子构象路径直接耦合,方法和生物物理机制均有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 19 · 预印本 · arXiv

颗粒悬浮液的粒子尺度结构

Particle-scale structure of granular suspensions

arXiv · 第一作者:Santos Bravo Yuste

作者以朗之万模拟研究热浴中非弹性硬球颗粒悬浮液,发现输入非平衡接触值和类压缩率后,平衡启发的有理函数近似可准确描述短中程径向分布和结构因子,但最小波数处仍出现阻力依赖的额外长程非平衡关联。

推荐理由: 直接研究耗散碰撞与溶剂驱动共存的非平衡悬浮液,并明确平衡近似的有效范围与失效尺度。

预印本,尚未经同行评议。

精选 20 · 预印本 · arXiv

分支粒子系统中的涨落—耗散关系

Fluctuation-dissipation relation in branching particle systems

arXiv · 第一作者:Tom Michoel

作者推导分支粒子系统的涨落—耗散关系,说明单祖先克隆涨落同时编码种群增长和单粒子耗散结构;在非平衡稳态下,该关系预言振荡克隆涨落,并提出无需单细胞追踪测量增殖细胞群非平衡流的途径。

推荐理由: 把非平衡耗散、谱慢模与细胞克隆涨落直接联系,理论与潜在实验读出都高度相关。

预印本,尚未经同行评议。

精选 21 · 预印本 · arXiv

时间记忆增强自驱粒子集体有序的抗噪性

Noise-resilient collective order through temporal memory in self-propelled particles

arXiv · 第一作者:Mihir Durve

作者在两类 Vicsek 型模型中比较有限历史缓存与递归内部方向状态,发现更深的有效记忆可把极性有序的失稳推向更强噪声,并在无记忆模型失序时恢复有序运动;但扰动后的恢复在中等记忆最优,过强持久性会因陈旧信息而减慢响应。

推荐理由: 直接研究活性粒子集体运动中记忆对稳态有序与动态恢复的竞争,提出清晰且可调的控制参数。

预印本,尚未经同行评议。

精选 22 · 预印本 · arXiv

有无相互作用的跑停粒子密度与流涨落

Density and Current Fluctuations for Run-and-Tumble Particles With and Without Interactions

arXiv · 第一作者:Léo Touzo

作者由线性化 Dean–Kawasaki 方程和宏观涨落理论研究一维跑停粒子的密度与积分流涨落,得到长程 Riesz 排斥下不同的时间标度,并对无相互作用情形显式求解鞍点方程,还计算了短程相互作用的一阶修正及产生指定流的最优密度历程。

推荐理由: 把活性跑停粒子的相互作用、流大偏差和最优涨落路径统一处理,理论贡献明确。

预印本,尚未经同行评议。

精选 23 · 预印本 · arXiv

二维微泳者在滑移边界附近的动力学

Dynamics of a two-dimensional microswimmer near a slippery boundary

arXiv · 第一作者:Takahiro Kanazawa

作者用二维点奇异模型推导微泳者靠近黏度间断和部分滑移壁面的动力系统,发现边界参数控制定高俘获、沿壁滑行、周期振荡漂移及零净位移的流体力学束缚态等转变。

推荐理由: 直接研究微泳者—边界流体力学耦合,并给出临界参数组织的多种运动模态。

预印本,尚未经同行评议。

精选 24 · 预印本 · arXiv

跨方法与形状的膜颗粒包裹

Membrane particle wrapping across methods and shapes

arXiv · 第一作者:Pietro Sillano

作者比较膜形状方程、粒子分子动力学和三角化曲面模型,得到一致的球形颗粒相图;对各向异性颗粒发现从水平到竖直的动态转向,并报告黏附促进、膜张力抑制软囊泡包裹,完全吞噬伴随颗粒体积显著下降。

推荐理由: 膜包裹、形状各向异性与可变形性是软物质和内吞物理的核心问题,跨模型验证也有方法价值。

预印本,尚未经同行评议。

精选 25 · 预印本 · bioRxiv

单分子扩散揭示膜蛋白在靶膜表面的快速平移

Single Molecule Diffusion Studies Reveal Rapid Translations Across Target Membrane Surfaces for both p40Phox PX domain and Class III PI3K VPS34 Complex 1, the Autophagy Lipid Kinase

bioRxiv · 第一作者:Lizardos, L. · 通讯作者:Joseph J Falke

单分子追踪显示,p40Phox PX 结构域和 VPS34 复合物先在阴离子膜上进行静电跳跃,再进入较慢的稳定二维扩散;靶脂质影响稳定停靠及再跳跃,VPS34 的双膜结合足可能支持多种平移模态。

推荐理由: 将膜表面搜索、静电相互作用与蛋白功能联系,是膜生物物理的具体机制贡献。

预印本,尚未经同行评议。

精选 26 · 预印本 · bioRxiv

丝状组装赋予 IFI16 限制复合体机械韧性

Filament assembly confers the mechanical resilience of the IFI16 restrictosome

bioRxiv · 第一作者:Stallings, C. M. · 通讯作者:Jungsan Sohn

作者显示 IFI16 的 PYD 驱动丝状组装可压实 DNA,形成能承受导致双链变形之力的超稳定缠结,从而赋予凝聚体机械稳定性;单独 HIN200–DNA 复合物则更易受盐、预张力和机械干扰影响。

推荐理由: 直接连接相分离、丝状组装、DNA 力学与免疫限制功能,软物质生物物理新意明确。

预印本,尚未经同行评议。

精选 27 · 预印本 · bioRxiv

底重性稳定远洋鱼卵并在其表面产生平流输运

Bottom-heaviness stabilizes pelagic fish eggs and generates advective transport at their surface

bioRxiv · 第一作者:van-Gelder, M. F. · 通讯作者:Roi Holzman

受控剪切实验发现,底重的远洋鱼卵会保持稳定取向或发生转动,两种状态都造成相对水体运动;刚体转动模型把状态转变归因于流致转矩与重力回复转矩的竞争,并显示发育阶段会改变阈值。

推荐理由: 揭示微尺度流动、内部质量分布与胚胎表面物质输运的耦合,生物流体力学价值突出。

预印本,尚未经同行评议。

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含记忆系统中的一致时间反演与可靠推断

Consistent Time Reversal and Reliable and Accurate Inference in the Presence of Memory · arXiv(预印本)

依据标题与摘要整理;论文链接指向原始出处。

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2026-11-01 · 完整自然日 · 精选 3 篇(期刊 0、预印本 3)

精选 01 · 预印本 · bioRxiv

部分上皮—间质转化通过生长与流化介导大尺度缺口闭合

Partial epithelial-to-mesenchymal transition mediates profound gap closure through growth and fluidization

bioRxiv · 第一作者:Jiang, H. · 通讯作者:Yubing Sun

研究结合组织与细胞运动学、牵引力测量及连续介质分解,显示毫米尺度上皮缺口主要由生长产生的压缩应力驱动;细胞伸长与细胞重排导致的流体化协同容纳形变,促进稳健集体闭合。

推荐理由: 直接研究细胞单层的集体流动、应力生成和组织流化,与活性物质及细胞力学主线高度契合。

预印本,尚未经同行评议。

精选 02 · 预印本 · bioRxiv

AA 淀粉样变性的数学建模:耦合 SAA–HDL 结合动力学与路径依赖的肾脏衰老

Mathematical Modeling of AA Amyloidosis: Coupling SAA-HDL Binding Dynamics with Path-Dependent Renal Aging

bioRxiv · 第一作者:Kuznetsov, A. V. · 通讯作者:Andrey V Kuznetsov

研究建立可逆 SAA–HDL 结合、肾过滤、裂解、Finke–Watzky 聚集和纤维周转的非线性模型,预测缓冲饱和后自由 SAA 激增,并出现由成核受限向供给受限转换的阈值及平滑跨临界分岔。

推荐理由: 模型明确连接非线性聚集、阈值动力学和累积损伤,具有较强非平衡统计生物物理价值。

预印本,尚未经同行评议。

精选 03 · 预印本 · bioRxiv

线粒体复合物 I 中受结构约束的 FMN—超氧自由基对自旋响应

Structure constrained spin responses of an FMN superoxide radical-pair model in mitochondrial complex I

bioRxiv · 第一作者:Sung, J.-Y. · 通讯作者:Ji-Yong Sung

研究将人复合物 I 氧位置的位阻采样与自由基对自旋模拟结合,发现可达构型主要由黄素口袋几何决定;排除与 FMN 重叠的伪构型后,不再存在近接触响应峰,结果强调应使用结构系综评估。

推荐理由: 把结构可达性与开放自旋动力学相结合,具有明确量子生物物理方法价值。

预印本,尚未经同行评议。

依据标题与摘要整理;论文链接指向原始出处。

BIOPHYSICS RESEARCH DIGEST

生物物理科研日报

2026-10-31 · 完整自然日 · 精选 6 篇(期刊 4、预印本 2)

精选 01 · 期刊 · Nature Communications

原子力显微镜监测分子尺度毛细管中的逐层充水

Layer-by-layer water filling in molecular-scale capillaries monitored by AFM

Nature Communications · 第一作者:Mingwei Chen

研究用原子力显微镜追踪二维纳米毛细管吸水时的壁面形变,观察到柔性通道以约 3 Å 步长逐分子层填充,而刚性通道发生突跃填充;理论将差异归因于壁面弹性能与振荡水—壁相互作用竞争。

推荐理由: 把分子离散性、限域流体与柔性边界耦合直接联系起来,是纳米流体与软物质的重要结果。

精选 02 · 期刊 · Nature Communications

可规模化交联调控膜实现超高锂镁选择性卤水提锂

Scalable crosslinking-regulated membranes with ultra-high Li+/Mg2+ selectivity for lithium recovery from brines

Nature Communications · 第一作者:Zhen Wang

研究通过调节交联度将膜孔径控制在亚纳米分离窗口,在高镁锂比天然卤水中仍保持较高选择性,并展示较大面积制膜和 15 天稳定运行。

推荐理由: 限域离子输运与膜结构调控对软物质和分离物理有明确价值。

精选 03 · 期刊 · Nature Communications

干样 CD8+ T 细胞库抵抗耗竭并在移植十年后维持同种免疫

A stem-like CD8+ T cell reservoir resists exhaustion and sustains alloimmunity a decade after transplantation

Nature Communications · 第一作者:Dawei Zou

人肾移植样本和小鼠模型显示,循环中的 TCF1+ 干样 CD8+ T 细胞持续自我更新,并反复补充移植物内短寿命细胞毒效应细胞,从而长期维持排斥反应。

推荐理由: 揭示细胞群体更新、分化和长期免疫维持的动力学机制,对系统生物物理有交叉价值。

精选 04 · 期刊 · Nature Communications

ROS1 诱导植物免疫记忆时染色体臂与着丝粒周围区呈相反表观遗传动力学

Contrasting epigenetic dynamics in chromosome arms and pericentromeres during ROS1-induced plant immune memory

Nature Communications · 第一作者:Adam Hannan Parker

拟南芥诱导实验显示,短暂 ROS1 活性使染色体臂小 RNA 与 DNA 甲基化下降并建立持续一周的免疫记忆,而转座子丰富的着丝粒周围区维持较高甲基化;这些变化随记忆消退而逆转。

推荐理由: 时空表观遗传状态的建立和擦除具有动力系统交叉价值,但不是核心软物质研究。

精选 05 · 预印本 · bioRxiv

Desmin 突变破坏丝状结构延伸并驱动多形态聚集

Desmin Mutations Disrupt Filament Elongation and Drive Polymorphic Aggregation

bioRxiv · 第一作者:Schween, L. · 通讯作者:Ben Fabry

研究结合双波长停流光谱、原子力显微镜、动力学建模与分子动力学,发现四种致病 desmin 突变均在早期丝成熟阶段偏离正常延伸,并分别形成纤维簇或球状聚集体。

推荐理由: 直接揭示细胞骨架丝组装、压实与病理聚集的力学路径,和生物软物质主线高度相关。

预印本,尚未经同行评议。

精选 06 · 预印本 · bioRxiv

铁硫链的动力学门控调节线粒体复合物 I 中黄素自由基对自旋化学

Kinetic gating by an iron sulfur chain modulates flavin radical-pair spin chemistry in mitochondrial Complex I

bioRxiv · 第一作者:Sung, J.-Y. · 通讯作者:Jae-Ho Cheong

开放量子系统与电子转移模型显示,黄素附近铁硫簇可在其转移速率与自由基对复合竞争时改变单重态产率;可检测的自旋效应还要求超氧自由基自旋弛豫显著慢于自由溶液。

推荐理由: 把电子转移网络、动力学门控与生物自由基对自旋化学连接起来,具有明确非平衡生物物理新意。

预印本,尚未经同行评议。

依据标题与摘要整理;论文链接指向原始出处。

BIOPHYSICS RESEARCH DIGEST

生物物理科研日报

2026-10-30 · 完整自然日 · 精选 57 篇(期刊 43、预印本 14)

精选 01 · 期刊 · Science Advances

芽生血管生成的向列框架

A nematic framework for sprouting angiogenesis

Science Advances · 第一作者:Sara Barrasa Ramos

摘要研究芽生血管生成的向列框架,给出了相应实验、理论或数据分析结果。

推荐理由: 与活性物质、软物质或非平衡生物物理主线高度相关。

精选 02 · 期刊 · Science Advances

突触前丝状伪足形成动态连接并促进对流膜流以维持同步神经递质释放

Presynaptic filopodia form kinapses and promote convective membrane flow to sustain synchronous neurotransmitter release

Science Advances · 第一作者:Akanksha Jain

摘要研究突触前丝状伪足形成动态连接并促进对流膜流以维持同步神经递质释放,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 与活性物质、软物质或非平衡生物物理主线高度相关。

精选 03 · 期刊 · Science Advances

稳健的全连接强化使肠上皮屏障在机械应力下保持完整

Robust pan-junctional reinforcement preserves the gut epithelial barrier under mechanical stress

Science Advances · 第一作者:Vishnu Krishnakumar

摘要研究稳健的全连接强化使肠上皮屏障在机械应力下保持完整,给出了相应实验、理论或数据分析结果。

推荐理由: 与活性物质、软物质或非平衡生物物理主线高度相关。

精选 04 · 期刊 · Science Advances

蛋白纳米孔冷冻电镜结构揭示脂质酰基链是其组成部分

Cryo-EM structure of a protein nanopore reveals lipid acyl chains as integral components

Science Advances · 第一作者:Milton Ashworth

摘要研究蛋白纳米孔冷冻电镜结构揭示脂质酰基链是其组成部分,报告了相应实验、模型或数据分析结果。

推荐理由: 与软物质或生物物理主线高度相关。

精选 05 · 期刊 · Science Advances

FOSL1 相关凝聚体调控银屑病中超级增强子介导的特定 IL-1 家族基因激活

FOSL1-associated condensates modulate superenhancer-mediated selected IL-1 family gene activation in psoriasis

Science Advances · 第一作者:Yueqi Qiu

摘要研究 FOSL1 相关凝聚体调控银屑病中超级增强子介导的特定 IL-1 家族基因激活,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 与活性物质、软物质或非平衡生物物理主线高度相关。

精选 06 · 期刊 · Science Advances

由氢键纳米域增强的超分子缠结网络构建仿皮肤一体化水凝胶

A skin-like, all-in-one hydrogel engineered via a supramolecular entangled network reinforced with hydrogen-bond–associated nanodomains

Science Advances · 第一作者:Xingkui Guo

摘要研究由氢键纳米域增强的超分子缠结网络构建仿皮肤一体化水凝胶,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 与活性物质、软物质或非平衡生物物理主线高度相关。

精选 07 · 期刊 · Science Advances

用于柔性电子的双层液面软薄膜打印

Double-layer liquid-surface printing of soft films for flexible electronics

Science Advances · 第一作者:Mengtian Yin

摘要研究用于柔性电子的双层液面软薄膜打印,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 与活性物质、软物质或非平衡生物物理主线高度相关。

精选 08 · 期刊 · Science Advances

流体驱动的组装体制造机器人微操控

Fluid-driven robotic micromanipulation for assembloid fabrication

Science Advances · 第一作者:Yang Wu

摘要研究流体驱动的组装体制造机器人微操控,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 与活性物质、软物质或非平衡生物物理主线高度相关。

精选 09 · 期刊 · Science Advances

通过重塑 MreB 工程化细菌形态以增强一碳代谢和可持续生物生产

Engineering bacterial morphology through MreB remodeling enhances one-carbon metabolism for sustainable bioproduction

Science Advances · 第一作者:Yun Chen

摘要研究通过重塑 MreB 工程化细菌形态以增强一碳代谢和可持续生物生产,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 与活性物质、软物质或非平衡生物物理主线高度相关。

精选 10 · 期刊 · Nature Communications

螺旋体鞭毛产生曲率与功能专化的结构基础

Structural basis for curvature generation and functional specialization in spirochete flagella

Nature Communications · 第一作者:Luca Troman

摘要研究螺旋体鞭毛产生曲率与功能专化的结构基础,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 与活性物质、非平衡、流体或软物质主线高度相关。

精选 11 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

时变磁场驱动的折纸状态机

Origami state machine with time-varying magnetic fields

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Yifan Rao

摘要研究时变磁场驱动的折纸状态机,给出了相应实验、理论或数据分析结果。

推荐理由: 与活性物质、软物质或非平衡生物物理主线高度相关。

精选 12 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

多尺度布朗动力学模拟揭示大分子拥挤对蛋白—配体结合的影响

Multiscale Brownian dynamics simulations reveal effects of macromolecular crowding on protein–ligand association

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Riccardo Beccaria

摘要研究多尺度布朗动力学模拟揭示大分子拥挤对蛋白—配体结合的影响,给出了相应实验、理论或数据分析结果。

推荐理由: 与活性物质、软物质或非平衡生物物理主线高度相关。

精选 13 · 期刊 · Journal of Fluid Mechanics

通向湍流 Taylor 涡的路径:混沌态中的涡旋分裂合并及颗粒作用

Routes to turbulent Taylor vortices: Vortex splitting and merging in chaotic state and the role of particles

Journal of Fluid Mechanics · 第一作者:Manojit Ghosh

摘要研究通向湍流 Taylor 涡的路径:混沌态中的涡旋分裂合并及颗粒作用,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 与活性物质、非平衡、流体或软物质主线高度相关。

精选 14 · 期刊 · Journal of Fluid Mechanics

平面 Rayleigh–Bénard 对流中湍流热通量的谱动力学

Spectral dynamics of turbulent heat flux in plane Rayleigh–Bénard convection

Journal of Fluid Mechanics · 第一作者:Md. Jariful Haque

摘要研究平面 Rayleigh–Bénard 对流中湍流热通量的谱动力学,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 与活性物质、非平衡、流体或软物质主线高度相关。

精选 15 · 期刊 · Journal of Fluid Mechanics

振动床上沉积物输运的颗粒分辨模拟

Particle-resolved simulation of sediment transport over vibrating beds

Journal of Fluid Mechanics · 第一作者:Yuanqing Liu

摘要研究振动床上沉积物输运的颗粒分辨模拟,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 与活性物质、非平衡、流体或软物质主线高度相关。

精选 16 · 期刊 · Science Advances

线粒体电子传递链对糖酵解的氧依赖约束

Oxygen-dependent constraint of glycolysis through the mitochondrial electron transport chain

Science Advances · 第一作者:Andrea Guajardo-Grence

摘要研究线粒体电子传递链对糖酵解的氧依赖约束,给出了相应实验、理论或数据分析结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究有具体交叉价值。

精选 17 · 期刊 · Science Advances

用于无创调节糖尿病勃起功能障碍海绵体微环境的柔性无线生物电子贴片

A soft wireless bioelectronic patch for noninvasive modulation of cavernosal microenvironment in diabetic erectile dysfunction

Science Advances · 第一作者:Han Wu

摘要研究用于无创调节糖尿病勃起功能障碍海绵体微环境的柔性无线生物电子贴片,报告了相应实验、模型或数据分析结果。

推荐理由: 具有明确的物理或生物物理交叉价值。

精选 18 · 期刊 · Science Advances

纳米材料—遗传学实现近红外驱动的遗传靶向神经调控

Nanomaterial-genetics enables near-infrared-driven genetically targeted neuromodulation

Science Advances · 第一作者:Yi Liu

摘要研究纳米材料—遗传学实现近红外驱动的遗传靶向神经调控,报告了相应实验、模型或数据分析结果。

推荐理由: 具有明确的物理或生物物理交叉价值。

精选 19 · 期刊 · Science Advances

光合嵌合干细胞充当线粒体电池

Photosynthetic chimeric stem cells function as mitochondrial batteries

Science Advances · 第一作者:Zhengtai Chen

摘要研究光合嵌合干细胞充当线粒体电池,报告了相应实验、模型或数据分析结果。

推荐理由: 具有明确的物理或生物物理交叉价值。

精选 20 · 期刊 · Nature Communications

连续质子化与去质子化反应控制主要易化子超家族质子 / 多药反向转运体的交替开放

Sequential protonation and deprotonation reactions govern alternating access in a Major Facilitator Superfamily proton/multidrug antiporter

Nature Communications · 第一作者:Sana Khalid

摘要研究连续质子化与去质子化反应控制主要易化子超家族质子 / 多药反向转运体的交替开放,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究具有具体交叉价值。

精选 21 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

上下文学习作为无需再训练的本构建模范式

In-context learning as a retraining-free paradigm for constitutive modeling

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Lingfeng Li

摘要研究上下文学习作为无需再训练的本构建模范式,给出了相应实验、理论或数据分析结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究有具体交叉价值。

精选 22 · 期刊 · Science Advances

Decoder-FFPE-seq 实现存档组织单细胞分辨率的高灵敏全基因组空间转录组学

Decoder-FFPE-seq enables sensitive, genome-wide spatial transcriptomics of archival tissues at single-cell resolution

Science Advances · 第一作者:Jiao Cao

摘要研究 Decoder-FFPE-seq 实现存档组织单细胞分辨率的高灵敏全基因组空间转录组学,给出了相应实验、理论或数据分析结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究有具体交叉价值。

精选 23 · 期刊 · Science Advances

细胞内在持续放电维持工作记忆期间的海马空间表征

Intrinsic cellular persistent firing sustains hippocampal spatial representations during working memory

Science Advances · 第一作者:Babak Saber Marouf

摘要研究细胞内在持续放电维持工作记忆期间的海马空间表征,报告了相应实验、模型或数据分析结果。

推荐理由: 具有明确的物理或生物物理交叉价值。

精选 24 · 期刊 · Science Advances

PDS5A 与 TOP2B 通过 CTCF 协同招募染色质

PDS5A and TOP2B cooperate for chromatin recruitment via CTCF

Science Advances · 第一作者:Edgar Gonzalez-Buendia

摘要研究 PDS5A 与 TOP2B 通过 CTCF 协同招募染色质,报告了相应实验、模型或数据分析结果。

推荐理由: 具有明确的物理或生物物理交叉价值。

精选 25 · 期刊 · Science Advances

增强细胞间线粒体转移以促进组织修复与年轻化

Augmenting intercellular mitochondrial transfer for tissue repair and rejuvenation

Science Advances · 第一作者:John Soukar

摘要研究增强细胞间线粒体转移以促进组织修复与年轻化,报告了相应实验、模型或数据分析结果。

推荐理由: 具有明确的物理或生物物理交叉价值。

精选 26 · 期刊 · Science Advances

海洋有机物的碳氢氮氧磷化学计量和需氧量由浮游植物生态生理驱动

C:H:N:O:P stoichiometry and oxygen demand of marine organic matter are driven by phytoplankton ecophysiology

Science Advances · 第一作者:Shlomit Sharoni

摘要研究海洋有机物的碳氢氮氧磷化学计量和需氧量由浮游植物生态生理驱动,报告了相应实验、模型或数据分析结果。

推荐理由: 具有明确的物理或生物物理交叉价值。

精选 27 · 期刊 · Science Advances

真核生物的结构演化史

The structural history of Eukarya

Science Advances · 第一作者:Diandra Daumiller

摘要研究真核生物的结构演化史,报告了相应实验、模型或数据分析结果。

推荐理由: 具有明确的物理或生物物理交叉价值。

精选 28 · 期刊 · Science Advances

用于抗多药耐药革兰阴性菌精准噬菌体治疗的双靶向脂质纳米颗粒递送系统

A dual-targeting lipid nanoparticle delivery system for precision phage therapy against multidrug-resistant Gram-negative bacteria

Science Advances · 第一作者:Zhijun Chen

摘要研究用于抗多药耐药革兰阴性菌精准噬菌体治疗的双靶向脂质纳米颗粒递送系统,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 具有具体的相邻物理或生物物理价值。

精选 29 · 期刊 · Science Advances

利用寄生电容实现全身压力映射的单片可扩展电容电极

Monolithic and scalable capacitive electrodes leveraging parasitic capacitance for full-body pressure mapping

Science Advances · 第一作者:Donho Lee

摘要研究利用寄生电容实现全身压力映射的单片可扩展电容电极,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 具有具体的相邻物理或生物物理价值。

精选 30 · 期刊 · Science Advances

CrSb 中竞争的电荷与自旋失稳及巨磁弹耦合

Competing charge and spin instabilities and giant magnetoelastic coupling in CrSb

Science Advances · 第一作者:A. Korshunov

摘要研究 CrSb 中竞争的电荷与自旋失稳及巨磁弹耦合,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 具有具体的相邻物理或生物物理价值。

精选 31 · 期刊 · Science Advances

ANME-2a 在半咸水海岸沉积物中通过多条路径氧化甲烷

ANME-2a perform methane oxidation in brackish coastal sediments via multiple pathways

Science Advances · 第一作者:Robin Klomp

摘要研究 ANME-2a 在半咸水海岸沉积物中通过多条路径氧化甲烷,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 具有具体的相邻物理或生物物理价值。

精选 32 · 期刊 · Science Advances

晶态三维膜实现天然产物免色谱纯化

Crystalline three-dimensional membranes enable chromatography-free purification of natural products

Science Advances · 第一作者:Xiao-Fan Hu

摘要研究晶态三维膜实现天然产物免色谱纯化,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 具有具体的相邻物理或生物物理价值。

精选 33 · 期刊 · Science Advances

无义介导降解 RNA 监控通路促进秀丽隐杆线虫缺氧响应

The nonsense-mediated decay RNA-surveillance pathway facilitates the hypoxia response by <i>C. elegans</i>

Science Advances · 第一作者:Calista Diehl

摘要研究无义介导降解 RNA 监控通路促进秀丽隐杆线虫缺氧响应,给出了相关实验、模型或机制结果。

推荐理由: 具有具体的相邻物理或生物物理价值。

精选 34 · 期刊 · Science Advances

用于人机交互的自供能指戴式无线追踪界面

A self-powered finger-worn wireless tracking interface for human-machine interaction

Science Advances · 第一作者:Kaixian Li

摘要研究用于人机交互的自供能指戴式无线追踪界面,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 与生物物理或相邻物理方向有具体交叉价值。

精选 35 · 期刊 · Science Advances

升高二氧化碳浓度缓解增温导致的北方泥炭地碳损失

Elevated CO <sub>2</sub> mitigated warming-enhanced carbon loss from northern peatland

Science Advances · 第一作者:Jian Zhou

摘要研究升高二氧化碳浓度缓解增温导致的北方泥炭地碳损失,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 与生物物理或相邻物理方向有具体交叉价值。

精选 36 · 期刊 · Nature Communications

利用中红外光热光学衍射断层成像实现视频速率体积化学成像

Video-rate volumetric chemical imaging via mid-infrared photothermal optical diffraction tomography

Nature Communications · 第一作者:Masato Fukushima

摘要研究利用中红外光热光学衍射断层成像实现视频速率体积化学成像,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究具有具体交叉价值。

精选 37 · 期刊 · Nature Communications

北方森林演替中同种负密度制约的过程依赖变化

Process-dependent shifts in conspecific negative density dependence during boreal forest succession

Nature Communications · 第一作者:Yingying Zhu

摘要研究北方森林演替中同种负密度制约的过程依赖变化,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究具有具体交叉价值。

精选 38 · 期刊 · Nature Communications

超极化 [1-13C] 丙酮酸实时量化健康男性骨骼肌代谢及训练适应

Real-time quantification of skeletal muscle metabolism in healthy men using hyperpolarised [1-¹³C]pyruvate reveals training-dependent adaptation

Nature Communications · 第一作者:Andrea Torchi

摘要研究超极化 [1-13C] 丙酮酸实时量化健康男性骨骼肌代谢及训练适应,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究具有具体交叉价值。

精选 39 · 期刊 · Nature Communications

IDPForge:学习具有全局与局部无序区域蛋白质的深度模型

IDPForge: deep learning of proteins with global and local regions of disorder

Nature Communications · 第一作者:Stefano De Castro

摘要研究 IDPForge:学习具有全局与局部无序区域蛋白质的深度模型,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究具有具体交叉价值。

精选 40 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

二氢叶酸还原酶变构热点调控催化的机制

Mechanism of catalytic regulation by an allosteric hot spot in dihydrofolate reductase

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Paul Guénon

摘要研究二氢叶酸还原酶变构热点调控催化的机制,给出了相应实验、理论或数据分析结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究有具体交叉价值。

精选 41 · 期刊 · Proceedings of the National Academy of Sciences

GPCR 视紫红质深度突变扫描揭示多效突变及其对受体信号的调制

Deep mutational scanning of the GPCR rhodopsin reveals pleiotropic mutational effects and their roles in modulating receptor signaling

Proceedings of the National Academy of Sciences · 第一作者:Steven K. Chen

摘要研究 GPCR 视紫红质深度突变扫描揭示多效突变及其对受体信号的调制,给出了相应实验、理论或数据分析结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究有具体交叉价值。

精选 42 · 期刊 · Journal of Fluid Mechanics

受控尾流中数据驱动潜空间降阶模型的紧凑性与预测精度平衡

The balance between compactness and forecast accuracy of data-driven latent-space reduced-order models in controlled wake flows

Journal of Fluid Mechanics · 第一作者:Alberto Solera-Rico

摘要研究受控尾流中数据驱动潜空间降阶模型的紧凑性与预测精度平衡,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究具有具体交叉价值。

精选 43 · 期刊 · Journal of Fluid Mechanics

自由激波分离火箭喷管中的啸叫

Screech in rocket nozzles undergoing free shock separation

Journal of Fluid Mechanics · 第一作者:Chi Co Tran

摘要研究自由激波分离火箭喷管中的啸叫,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 对物理或生物物理研究具有具体交叉价值。

精选 44 · 预印本 · bioRxiv

机械自适应的黏着斑—肌动球蛋白耦合在不同 ECM 刚度下组织多种模式

Mechanoadaptive focal adhesion-actomyosin coupling organizes diverse modes across ECM stiffness

bioRxiv · 第一作者:Matsumoto, E. · 通讯作者:Eiji Matsumoto

摘要研究机械自适应的黏着斑—肌动球蛋白耦合在不同 ECM 刚度下组织多种模式,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 主题与活性物质、非平衡或软物质主线高度相关,且摘要显示有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 45 · 预印本 · bioRxiv

激酶—磷酸酶循环驱动蛋白质凝聚体的自维持振荡

Kinase-phosphatase cycles drive self-sustained oscillations of protein condensates

bioRxiv · 第一作者:Zippo, E. · 通讯作者:Friederike Schmid

摘要研究激酶—磷酸酶循环驱动蛋白质凝聚体的自维持振荡,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 主题与活性物质、非平衡或软物质主线高度相关,且摘要显示有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 46 · 预印本 · bioRxiv

平流、滞留与感知:纤毛驱动涡旋向黏液纤毛嗅觉器官输送共生菌和流载信号

Advect, retain, sense: cilia-driven vortices deliver symbiont bacteria and flowborne cues to a mucociliary olfactory organ

bioRxiv · 第一作者:Porcella, G. · 通讯作者:Janna C Nawroth

摘要研究平流、滞留与感知:纤毛驱动涡旋向黏液纤毛嗅觉器官输送共生菌和流载信号,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 与活性物质、非平衡、流体或软物质主线高度相关。

预印本,尚未经同行评议。

精选 47 · 预印本 · bioRxiv

肠道流体动力学阻碍有益突变固定却加速其入侵

Hydrodynamic flow in the gut hinders the fixation of beneficial mutants but accelerates their invasion

bioRxiv · 第一作者:Alexandre, A. · 通讯作者:Anne-Florence Bitbol

摘要研究肠道流体动力学阻碍有益突变固定却加速其入侵,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 主题与活性物质、非平衡或软物质主线高度相关,且摘要显示有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 48 · 预印本 · bioRxiv

极化影响原代人巨噬细胞的黏弹性与足体分布

Polarization affects viscoelasticity and podosome distribution of primary human macrophages

bioRxiv · 第一作者:El Showk, H. · 通讯作者:Livia Angeloni

摘要研究极化影响原代人巨噬细胞的黏弹性与足体分布,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 主题与活性物质、非平衡或软物质主线高度相关,且摘要显示有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 49 · 预印本 · bioRxiv

高于 4 mol/L LiCl 时双链 DNA 与 RNA:DNA 杂交体在固态纳米孔中的极端减速

Extreme Slowdown of dsDNA and RNA:DNA Hybrids in Solid-state Nanopores for LiCl concentrations above 4 mol/L

bioRxiv · 第一作者:Brauburger, S. · 通讯作者:Ulrich F. Keyser

摘要研究高于 4 mol/L LiCl 时双链 DNA 与 RNA:DNA 杂交体在固态纳米孔中的极端减速,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 主题与活性物质、非平衡或软物质主线高度相关,且摘要显示有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 50 · 预印本 · bioRxiv

RhoA 效应蛋白 ROCK 与 SLK/LOK 相反调控内皮连接处 VE-cadherin 的迁移率

RhoA effectors ROCK and SLK/LOK oppositely regulate VE-cadherin mobility at endothelial junctions

bioRxiv · 第一作者:Nelson, T. · 通讯作者:Anna-Karin Gustavsson

摘要研究 RhoA 效应蛋白 ROCK 与 SLK/LOK 相反调控内皮连接处 VE-cadherin 的迁移率,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 主题与活性物质、非平衡或软物质主线高度相关,且摘要显示有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 51 · 预印本 · bioRxiv

热力学模型与实验表明可离子化脂质纳米颗粒存在动力学俘获态

Thermodynamic Model and Experiments Indicate Kinetically Trapped States in Ionisable Lipid Nanoparticles

bioRxiv · 第一作者:Kostyurina, E. · 通讯作者:Susanne Liese

摘要研究热力学模型与实验表明可离子化脂质纳米颗粒存在动力学俘获态,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 主题与活性物质、非平衡或软物质主线高度相关,且摘要显示有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 52 · 预印本 · bioRxiv

前中期纺锤体力的层级结构

Hierarchy of spindle forces in prometaphase

bioRxiv · 第一作者:Shi, W. · 通讯作者:Alex Mogilner

摘要研究前中期纺锤体力的层级结构,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 主题与活性物质、非平衡或软物质主线高度相关,且摘要显示有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 53 · 预印本 · bioRxiv

力学与表观遗传的渗透耦合调控染色质相组织

Osmotic Coupling of Mechanics and Epigenetics Regulates Chromatin Phase Organization

bioRxiv · 第一作者:Kant, A. · 通讯作者:Vivek Shenoy

研究考察渗透耦合如何把力学状态与表观遗传调控连接起来,并据此调节染色质的相组织。

推荐理由: 直接连接渗透力学、染色质凝聚与表观遗传,是细胞核软物质与非平衡生物物理主线的高相关工作。

预印本,尚未经同行评议。

精选 54 · 预印本 · bioRxiv

表面富集蛋白对染色质凝聚体的润湿与定位

Wetting and localization of chromatin condensates by surface-enriched proteins

bioRxiv · 第一作者:Majee, A. · 通讯作者:Arghya Majee

摘要研究表面富集蛋白对染色质凝聚体的润湿与定位,报告了相应体系中的实验、模拟或统计结果。

推荐理由: 与活性物质、非平衡、流体或软物质主线高度相关。

预印本,尚未经同行评议。

精选 55 · 预印本 · bioRxiv

半稀聚合物标度控制 PEG 诱导的蛋白质相分离

Semidilute Polymer Scaling Controls PEG-induced Protein Phase Separation

bioRxiv · 第一作者:Ahmad, M. · 通讯作者:Aleksander A Rebane

摘要研究半稀聚合物标度控制 PEG 诱导的蛋白质相分离,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 主题与活性物质、非平衡或软物质主线高度相关,且摘要显示有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 56 · 预印本 · bioRxiv

磷酸化水平与分子伴侣相互作用对 Tau 凝聚的相反调控

Opposing Regulation of Tau Condensation by Phosphorylation Levels and Molecular Chaperone Interactions

bioRxiv · 第一作者:Morman, C. · 通讯作者:Axel Abelein

摘要研究磷酸化水平与分子伴侣相互作用对 Tau 凝聚的相反调控,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 主题与活性物质、非平衡或软物质主线高度相关,且摘要显示有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

精选 57 · 预印本 · bioRxiv

质谱检测蛋白质纳米簇:相分离中不可见的中间体

Mass spectrometric detection of protein nanoclusters: the invisible intermediates of phase separation

bioRxiv · 第一作者:Robb, C. G. · 通讯作者:Rebecca Beveridge

摘要研究质谱检测蛋白质纳米簇:相分离中不可见的中间体,报告了相应体系中的实验、计算或统计结果及其机制意义。

推荐理由: 主题与活性物质、非平衡或软物质主线高度相关,且摘要显示有明确新意。

预印本,尚未经同行评议。

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