BIOPHYSICS RESEARCH DIGEST
生物物理科研日报
2026-10-18 · 完整自然日 · 精选 6 篇(期刊 3、预印本 3)
溶剂异质性调控超分子聚合的组装路径
Solvent heterogeneity regulates assembly pathways in supramolecular polymerization
Nature Communications · 第一作者:Goutam Ghosh
两亲钯配合物的实验与理论显示,混合溶剂中的微观液液分离形成富二氧六环微区,提高局部单体浓度。热退火增强分子迁移及微区聚并,使动力学控制离散结构转为稳定一维纤维,分子中心与氢键基序进一步调节路径。
推荐理由: 溶剂局部异质性如何改写超分子聚合路径是直接软物质问题,连接相分离与动力学组装。
隐球菌细胞壁分子架构揭示物种特异的壳聚糖依赖重塑
Molecular architecture of Cryptococcus cell walls reveals species-specific chitosan-dependent remodeling
Nature Communications · 第一作者:Ankur Ankur
固态核磁结合形态分析显示,隐球菌细胞壁由刚性 α 葡聚糖—几丁质结构和较动态基质组成,壳聚糖调节水化及柔性。其缺失在两物种引起不同多糖网络重塑与暴露变化,说明相似组分可采用不同结构补偿。
推荐理由: 生物聚合物网络的刚性、水化和重塑有明确材料物理价值,避免把结构差异自动等同主动发力机制。
拟杆菌—大肠杆菌相互作用促进对艰难梭菌的定植抵抗
Bacteroides–Escherichia interactions contribute to colonization resistance against Clostridioides difficile
Nature Communications · 第一作者:Achuthan Ambat
合成肠菌群在连续流反应器中接受抗生素及病原挑战,模型定位大肠杆菌与拟杆菌相关互作,代谢及靶向验证支持交叉营养和资源竞争的抑制作用。患者数据进一步关联其定植抵抗意义,但不能将群落指标直接当作治疗处方。
推荐理由: 可控群落实验连接种间代谢互作与涌现抗入侵能力,对生态动力学有具体交叉价值。
双链核酸中依赖序列的构象与力学景观
Sequence-dependent conformational and mechanical landscapes of double-stranded nucleic acids
bioRxiv · 第一作者:Sharma, R. · 通讯作者:Rahul Sharma
cgNA+ 由原子模拟参数化,比较双链 RNA、DNA:RNA 杂交及修饰 DNA 的序列依赖平衡形状和刚度。模型预测相邻序列影响可延伸至八聚体,并给出沟宽与持久长度差异;精度以原子模拟为参照,不等同已获所有实验验证。
推荐理由: 非局域序列依赖弹性和修饰效应直接关联聚合物生物物理,提供跨核酸类型的大尺度力学工具。
预印本,尚未经同行评议。
蛋白拥挤缓冲膜流动性
Protein Crowding Buffers Membrane Fluidity
bioRxiv · 第一作者:Javanainen, M. · 通讯作者:Matti Javanainen
粗粒化与全原子模拟比较拥挤蛋白膜的脂质结构及扩散,发现蛋白在所有研究温度均降低脂质有序度,且低温作用更强。覆盖约半膜面积后高低温态趋同、液—凝胶转变消失,区别于胆固醇对两相相反作用的机制。
推荐理由: 直接解释膜蛋白浓度如何缓冲膜流动性及温度响应,是平衡膜相行为问题,不需标为活性物质。
预印本,尚未经同行评议。
通过基序截留增强 DNA 扫描与靶点特异性
Enhanced DNA Scanning and Target Specificity via Motif Sequestration
bioRxiv · 第一作者:Montgomery, J. S. · 通讯作者:Mark P Foster
核磁、单分子追踪及光镊实验显示,Cre 末端暂时遮蔽 DNA 结合面,在非靶序列保持自抑制并促进一维扫描,识别靶位点时解除。去除末端反而使扩散停滞,说明降低非特异结合可同时提升搜索效率与特异组装。
推荐理由: 直接揭示构象门控如何平衡目标搜索和非生产性吸附,对单分子扩散与分子识别有明确贡献。
预印本,尚未经同行评议。
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